自2016年1月1日起实行的研发费加计扣除新规定，按规定在2016年度企业所得税汇算清缴兑现。在汇算清缴开始前夕，国家税务总局发出通知，明确研发费加计扣除执行口径，要求各级税务机关开展多维度、多渠道的宣传，优化纳税服务，确保企业应享尽享研发费用加计扣除。
　　
　　今年汇算清缴期申报研发费加计扣除，申报程序、扣除范围等与往年有变化，企业需关注政策执行口径，掌握操作要点，才能大程度享受优惠，规避风险。
　　
　　重大利好：明确多个执行口径
　　
　　国家税务总局发出《关于进一步做好企业研究开发费用税前加计扣除政策贯彻落实工作的通知》（税总函〔2016〕685号），要求“切实在2017年1月1日~5月31日企业所得税汇算清缴中做好研究开发费用税前加计扣除税收优惠政策落实工作”。
　　
　　税总函〔2016〕685号文件对落实《财政部、国家税务总局、科学技术部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号）文件具有重要的政策导向意义，明确了加计扣除政策执行口径，利好企业研发活动开展。
　　
　　政策导向重大利好
　　
　　税总函〔2016〕685号文件在政策执行口径的导向上明显有利于企业，特别凸显税务机关的服务职能，提出“从现在起至整个企业所得税汇算清缴期间，各级税务机关要充分利用官方网站、微信、微博、APP等方式开展多维度、多渠道的宣传，提醒纳税人及时申报享受加计扣除优惠政策”，“要通过纳税人学堂等方式开展‘面对面’的精准辅导，扩大宣传辅导覆盖面，方便企业及时了解政策和管理要求”，“要充分发挥12366纳税服务热线作用，统一政策口径，规范政策解答，及时为企业答疑解惑”，“如企业申报享受加计扣除优惠政策，但账证不健全、资料不齐全或适用优惠政策不准确的，各级税务机关要积极做好辅导解释工作，帮助企业建账建制，补充资料，确保企业享受加计扣除优惠政策”等。
　　
　　事实上，作为征税实施机关的税务机关不仅应该依法征税，切实做好相关税收法规的宣传、咨询等服务工作也是其职能之一。税收征管法第七条明确规定，“税务机关应当广泛宣传税收法律、行政法规，普及纳税知识，无偿地为纳税人提供纳税咨询服务”。税总函〔2016〕685号文件突出政府的服务职能，彰显了依法治税的理念。
　　
　　既往涉税问题不影响加计扣除
　　
　　税总函〔2016〕685号文件明确要求，“各级税务机关在落实加计扣除优惠政策时，应以核实企业享受2016年度优惠的有关情况为基准，原则上不核实以前年度有关情况。如企业以前年度存在或发现存在涉税问题，应按相关规定另行处理，不得影响企业享受2016年度加计扣除优惠政策”。
　　
　　对于企业之前涉税问题，应该严格按照税收征管法等相关规定进行处理，主要法律责任包括：（1）补缴税款、缴纳滞纳金；（2）涉嫌偷逃税的，应按照税收征管法和刑法的规定，进行行政和刑事处罚。
　　
　　再次强调“3年”追溯享受期
　　
　　财税〔2015〕119号文件明确规定，“企业符合本通知规定的研发费用加计扣除条件而在2016年1月1日以后未及时享受该项税收优惠的，可以追溯享受并履行备案手续，追溯期限长为3年”；税总函〔2016〕685号文件再次强调，“如企业2016年度未及时申报享受加计扣除优惠政策，可在以后3年内追溯享受”。
　　
　　税总函〔2016〕685号文件以及财税〔2015〕119号文件均未明确“未及时”的具体认定标准，实际原因可能错综复杂，包括税企双方的主观、客观原因，相关第三方以及外部客观原因等，如何界定，后续实操中需要明确。即使适用口径宽松，但是从企业财务和现金管理的角度来看，尽早享受税收优惠更为有利，主要表现在：（1）减少资金占用，节约现金流压力；（2）防范后续追溯享受面临的潜在税企争议，以及后续引发的涉税法律风险。
　　
　　税务机关应在10日内“解决”企业诉求
　　
　　税总函〔2016〕685号文件规定，“对纳税人反映的相关问题和投诉，各级税务机关应当在接到问题和投诉后的10个工作日内予以解决”。
　　
　　良好的征纳关系和较高的企业税法遵从度，既来自于完善的税法、规范的执法，又来自于税企之间积极有效的互动。税收征管法第八条规定，“纳税人、扣缴义务人有权向税务机关了解国家税收法律、行政法规的规定以及与纳税程序有关的情况”，“纳税人、扣缴义务人有权控告和检举税务机关、税务人员的违法违纪行为”。对于如何落实上述纳税人的权力，税总函〔2016〕685号文件给了较为具体的对策，要求10日内解决。当然，何为“解决”，标准如何界定，会成为后续执行中一个潜在的争议点。
　　
　　企业应提高享受税收优惠的合规性
　　
　　税总函〔2016〕685号文件反复强调，做好研发费用加计扣除优惠政策的“贯彻落实”，“加强督促检查，加大落实力度”。
　　
　　需要注意的是，税总函〔2016〕685号文件并没有对研发费用加计扣除享受的实体、程序作出新的规定，而应严格按照财税〔2015〕119号文件执行。财税〔2015〕119号文件虽然减少了审核程序，扩大了费用范围，但同时规定税务机关加强该项优惠政策的优惠管理，并明确年度核查面不得低于20%。因此，企业应当从完善研发项目管理、合理准确归集研发费用和设置研发费用辅助账等方面增强风险防范意识，提高危机化解能力。
　　
　　创新企业：掌握四个实操要点
　　
　　与2008年发布实施的《国家税务总局关于印发〈企业研究开发费用税前扣除管理办法（试行）〉的通知》（国税发〔2008〕116号）相比，财税〔2015〕119号文件作了较大调整，包括受益范围扩大、简化归集核算管理和追溯享受等。相关创新企业应关注如下实务操作建议，以便享受政策便利、减少涉税风险。
　　
　　了解申报程序，充分准备备案及留存备查资料
　　
　　国税发〔2008〕116号文件第十三条规定，主管税务机关对企业申报的研究开发项目有异议的，可要求企业提供政府科技部门的鉴定意见书。根据该规定，企业申报研发费用加计扣除，需提请科委鉴定；科委通过之后，企业报送资料至主管税局机关提交审核；审核通过，准予扣除，也即科委鉴定是前置性和必经程序。
　　
　　财税〔2015〕119号文件第五条第三项规定，税务机关对企业享受加计扣除优惠的研发项目有异议的，可以转请地市级（含）以上科技行政主管部门出具鉴定意见，科技部门应及时回复意见。根据该规定，科委鉴定不再作为前置性环节，由企业直接将申报资料提交税务机关，税务机关有异议可转请地市科技部门出具鉴定意见。
　　
　　建议：
　　
　　根据财税〔2015〕119号文件，加计扣除申报无须再通过科委鉴定，减少了审核程序，对企业来讲是一大利好，但也导致许多企业面临不确定项目是否可以进行加计扣除的困惑。因此，企业应当规范研发项目的管理，通过设置完善的立项、预算、审批、决算等对研发项目进行全程管理；准备完善的备案及留存备查资料。
　　
　　研发费用加计扣除实行备案管理，根据《国家税务总局关于发布〈企业所得税优惠政策事项办理办法〉的公告》（国家税务总局公告2015年第76号）的规定，现将企业需准备资料整理如下（见图表）。
　　
　　合理归集人员人工费用，编制研发人员工时分配表
　　
　　财税〔2015〕119号文件对于人员人工费用取消了“在职”的要求，对外聘研发人员的劳务费用也可以进行加计扣除，符合企业对研发灵活性的要求。
　　
　　同时，《国家税务总局关于企业研究开发费用税前加计扣除政策有关问题的公告》（国家税务总局公告2015年第97号）第六条第（三）款第4项明确了企业应当不迟于年度汇算清缴纳税申报时，向税务机关报送《企业所得税优惠事项备案表》和研发项目文件完成备案，以及留存备查的资料，其中包括“从事研发活动的人员和用于研发活动的仪器、设备、无形资产的费用分配说明（包括工作使用情况记录）”。费用分配说明能够更精准地说明企业研发费用中人员人工费用的产生过程，在适应企业研发多样性的基础上便于税务机关的后续管理。
　　
　　建议：
　　
　　1.完善对研发人员的管理。企业可根据规模成立专门的研发部门，或确定研发项目组成员，留存相关的审批设立文件备查。
　　
　　2.编制研发人员工时分配表。（1）若科技人员同期参与多个项目的研发，应当根据参与各个项目的工时编制工时分配表，将该研发人员的工资、薪金等按照实际参与项目的工时合理分配，并留存工时分配表备查。（2）若科技人员并非专门从事研发的人员，同时承担生产或其他岗位工作，或某项目研发周期较短，应当编制工时分配表，根据该科技人员每月实际从事研发的时间按月汇总，从而合理归集该部分人员人工费用。
　　
　　严格区分生产用和研发用，编制研发领料单、审批单等辅助核算
　　
　　财税〔2015〕119号文件扩大了直接投入、折旧费用、无形资产摊销费用的范围，取消“专门”的限制。但同时规定，企业应对研发费用和生产经营费用分别核算，准确、合理归集各项费用支出，对划分不清的，不得实行加计扣除。
　　
　　实践中，税务机关在企业可加计扣除费用进行核查时，若企业在“直接投入、折旧”等方面的费用过高，特别是占据总的材料成本及总的折旧金额比例过高时，会要求企业出具说明。
　　
　　建议：
　　
　　企业应当在日常的经营管理中严格区分生产用和研发用，编制领料单和审批单进行辅助核算。研发费用分配比例随意是企业中比较常见的问题，例如折旧费用与长期待摊费用、无形资产摊销费用、直接投入、人员人工等均会涉及此类问题。若企业单纯的核定某一百分比作为分配比例而没有相应的依据作为支撑，很难通过检查，而审批单的设置能较好地说明分配比例的设定，为研发费用再分配提供较强的数据支撑。
　　
　　建立研发费用辅助账
　　
　　财税〔2015〕119号文件从要求企业“必须对研究开发费用实行专账管理”改为“对享受加计扣除的研发费用按研发项目设置辅助账”，减轻了企业的会计核算负担，但对于没有建立研发费用辅助账的企业而言，是一大挑战。
　　
　　建议：
　　
　　建立研发费用辅助账。财税〔2015〕119号文件附件包含了辅助账的样表，给企业以参考，企业应当建立研发费用辅助账留存备查。具体流程包括：
　　
　　设立符合企业自身研发需求的科目与完备的凭证体系→收集原始资料（包括研发费用明细账、与研发活动有关的有效凭证等）→分项目、分年度建立研发费用辅助账→将有效凭证和辅助账进行比对核查。